约翰霍普金斯大学经济学系研究生阶段开设有以下两个学位项目，分别是：

经济学博士：为期5-6年（视论文完成情况）。经济学硕士项目并不面向校外学生招生，该项目仅作为为PhD项目做准备的项目，或未修完PhD项目全部课程的学生授予。该项目要求申请者本科毕业，拥有经济学理论、统计学和数学背景，修读过微分方程、积分和线性代数课程。被录取的学生通常修读过至少2学期的微积分和线性代数，另外，招生官偏向同时修读过其他课程的申请者，如高等微积分、微分方程、概率论和实分析。注意：该项目不接受转学生

应用经济学硕士：为期3-4个学期，共需修读30个学分（10门课程）。要求申请者本科毕业，不限专业，但要求拥有一定的经济学（如学习过微观经济学、宏观经济学、国际经济学等课程）外加相当的微积分基础。要求GPA不低于3.0分，无需GRE成绩——因为学校认为微积分的成绩更能说明申请者的数学分析能力。该项目包含有较多的计量内容，属于夜校项目，不提供internship，不适合将来欲攻读经济学PhD的学生，但适合将来欲攻读公共政策PhD的学生。该项目录取学生的人数约近200，多位Part-time学生，平均年龄在28岁左右。该项目还可以选择一个金融经济学的方向

经济学博士项目每年收到约500份申请，招生计划一般为12人。数学系向PhD学生提供6份Fellowship奖学金，涵盖全部学费外加一个生活补助，补助金额在$22,000-$28,000之间，余下的学生将获得学费奖学金，也就是说学生无需缴纳学费。TA和RA奖学金一般向2、3、4、5年级学生提供，涵盖全部学费，生活补助金额在$22,000以上。