卡耐基梅隆大学生物医学工程系开设的研究生学位项目有：

生物医学工程博士：分直接申请和高级申请，直接申请面向本科毕业生，需修读84个课程学分，为期4-5年；高级申请面向硕士研究生，修读学分42个，3年即可读完。要求申请者本科毕业，拥有工程学或工程相关专业背景，如：计算机科学、生物科学、物理、化学、数学、应用数学等。能够熟练掌握生命科学、计算基础。核心课程包括：分子与细胞生物学、生理学、生物成像与生物信息学、生物材料、生物力学，共计修读45个学分。该项目以研究内容为主，需要撰写毕业论文，所有博士研究生均可获得全额奖学金，包括学费以及按月发放的生活补助，奖学金形式包括全奖、助教、助研等。此外，中国学生还可申请中国国家留学基金管理委员会研究生奖学金计划，具体可见外部链接

生物医学工程硕士：为期16-21个月（大概1.5-2年）。该项目分研究内容和实习内容两个方向，如想继续攻读博士学位项目需申请前者，后者将与该学院的另一项目工程技术创新管理联合开设本硕连读项目。该项目以授课内容为主，核心课程包括：分子与细胞生物学、生理学、生物成像与生物信息学、生物材料、生物力学，共计修读45个学分。研究方向硕士可根据系里情况申请RA/TA奖学金，但名额有限且金额有限，还可转入实习方向硕士

研究方向：要求申请者本科毕业，拥有工程学或工程相关专业背景，如：计算机科学、生物科学、物理、化学、数学、应用数学等。能够熟练掌握生命科学、计算基础

实习方向：仅面向卡内基梅隆大学本科在校生，可在大三第一学期或大四内开始申请，申请截止日期为4月30日

双学位项目：

医学博士与生物医学工程博士双学位项目：该项目将医学院和工程学院联合起来，为学生提供理论+临床实践

生物医学工程与工程技术创新管理本硕连读项目：为期21个月（大概2年）