佩伯代因大学工商管理专业研究生阶段设有以下MBA项目，分别是：

全日制MBA：根据申请者专业背景不同，设有以下三种课程设置，分别是：

12个月 MBA：属快捷MBA项目，需修读3个学期，要求申请者本科毕业，拥有商学专业背景，以及3年以上工作经验，无需GMAT/GRE成绩。2016-2017学年，就读整个项目的学费为$71,700。

15个月 MBA：属快捷MBA项目，需修读4个学期，要求申请者本科毕业，拥有非商学专业背景，以及3年以上工作经验，必需GMAT/GRE成绩，无最低分数要求。2016-2017学年，就读整个项目的学费为$95,600。

2年MBA：属传统为期2年的MBA项目，需修读5个学期，含暑期实习，共需修读61个学分，要求申请者本科毕业，不限专业背景，拥有1年以上工作经验，必需GMAT/GRE成绩，无最低分数要求。2016-2017学年，就读整个项目的学费为$95,600。

非全日制MBA：该项目包含以下三类课程设置，分别是：

MBA Fast Track Option：MBA快捷课程，为期20个月，共需修读40个学分，要求申请者本科毕业，拥有商学专业背景，以及2年以上相关工作经验，本科商科专业课程GPA3.5以上，GRE阅读161分以上，GRE数学150分以上。

MBA Online：MBA远程教育课程。

MBA Flex Option：将函授与远程教育相结合的课程形式。

国际MBA：为佩伯代因大学与美国以外大学合作开设的MBA项目。

高管工商管理硕士：为期15个月，要求申请者拥有10年以上工作经验以及1年公司高层管理经验。该项目属非全日制项目，每月一次课程，每次课程为期3天。

高级工商管理硕士：为期19个月，要求申请者拥有7年以上工作经验，以及2年管理经验。该项目属非全日制项目，平均每三周上一次课。

法学博士与工商管理硕士：属双学位项目。

工商管理硕士与公共政策硕士：属双学位项目。