罗格斯大学化学与生物化学工程系研究生开设有5个学位项目，分别是：

化学与生物化学工程理学硕士：共计30个学分。开设有全日制和非全日制授课项目。非全日制授课项目主要向在职人员提供。分带毕业论文（含24个授课学分）和不带毕业论文（含30个授课学分）两种模式。该项目要求申请者本科毕业，拥有化学工程专业背景，非相关专业背景者需完成特定的前置课程要求，按要求国际学生可转12个学分。核心课程有：高级运输现象一、高级运输现象二、化学与生物化学工程分析方法、高级化学工程与热力学和动力学，催化与反应器设计。系里基本不向硕士项目学生提供奖学金。

制药工程与科学硕士：共计30个学分。该项目以授课内容为主，无需撰写毕业论文。核心课程有：制药工艺设计一、制药工艺设计二、制药运营统计分析与设计、制药开发、管理与吸收和制药材料工程。系里基本不向硕士项目学生提供奖学金。

化学与生物化学工程硕士：提供全日制、非全日制和远程在线授课项目。系里基本不向硕士项目学生提供奖学金。

化学工程商业科学硕士：为期1-2年，共计修读43个学分。是一门将工程、科学和数学与商业政策相关联的专业硕士项目。核心课程包括：核心课程包括：金融与会计、市场营销、传播与领导力、管理科学与技术、伦理道德与创业管理。在这里可理解为MS/MBA项目。系里基本不向硕士项目学生提供奖学金。

化学与生物化学工程博士：共计72个学分（含30个授课学分）。该项目以研究内容为主，需要撰写毕业论文。核心课程有：高级运输现象一、高级运输现象二、化学与生物化学工程分析方法、高级化学工程与热力学和动力学，催化与反应器设计。博士生一旦被录取在第一年基本上可获得学系或学校授予的Fellowship奖学金，一年后主要是导师授予的TA/RA等奖学金。