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约翰霍普金斯大学 | 新型人工智能血液检测检测肝癌
指南者留学 2022-11-22 11:19:32
阅读量:1346

约翰霍普金斯大学基梅尔癌症中心在2021年的一项研究中开发并使用了一种新的人工智能血液检测技术,成功检测出肺癌,现在在一项对724人的新研究中检测出了80%以上的肝癌。

 

这种血液检测被称为DELFI,是早期拦截DNA片段评估的缩写,它检测流入血液的癌细胞DNA片段的变化,即细胞游离DNA (cell-free DNA),简称cfDNA。在最近的研究中,研究人员使用DELFI技术对来自美国、欧盟和香港的724个人的血浆样本进行检测,以检测肝细胞癌(HCC),一种肝癌。

 

研究人员认为,这是第一个在两个高风险人群中独立验证的全基因组碎片化分析,涉及不同种族和民族的不同肝癌相关原因。

 

他们的研究结果发表在11月18日的《癌症发现》和美国癌症研究协会特别会议上:癌症的精确预防、早期检测和拦截。

 

根据一项对肝病负担的全球分析,估计全世界有4亿人因慢性肝病(包括慢性病毒性肝炎或非酒精性脂肪肝)导致的肝硬化而罹患HCC的风险更高。

 

john Hopkins Kimmel癌症中心肿瘤学教授、癌症遗传学和表观遗传学项目联合主任Victor Velculescu说:“增加肝癌的早期检测可以挽救生命,但目前可用的筛查测试没有得到充分利用,并遗漏了许多癌症。”Victor Velculescu与胃肠病学研究员Zachariah Foda共同领导了这项研究;Akshaya Annapragada,医学博士/博士学生;以及约翰霍普金斯大学医学院的医学助理教授艾米·金。

 

Foda解释说,在研究的724份血浆样本中,501份来自美国和欧洲,其中包括75名HCC患者的样本,用于训练和验证机器学习模型,这是一种使用数据和算法来提高准确性的人工智能。为了验证,我们对来自香港的223份血浆样本进行了分析,其中包括90名HCC患者、66名乙肝病毒感染者、35名乙肝相关肝硬化患者和32名无潜在危险因素的患者。

 

DELFI技术通过研究基因组不同区域循环中游离细胞DNA的大小和数量,利用血液测试来测量DNA在细胞核内的包装方式。健康细胞将DNA包装得像一个井井有条的手提箱,基因组的不同区域被小心地放在不同的隔间里。相比之下,癌细胞的细胞核就像更杂乱的手提箱,基因组中的物品被随意地扔了进去。当癌细胞死亡时,它们会以混乱的方式将DNA片段释放到血液中。

 

DELFI通过检查数百万cfDNA片段的异常模式,包括不同基因组区域DNA的大小和数量,来确定癌症的存在。研究人员说,DELFI方法只需要低覆盖率的测序,使该技术在筛查设置中具有成本效益。

 

在最新的研究中,研究人员对从血浆样本中分离出来的cfDNA片段进行了测试——之前被证明可以准确地对肺癌进行分类。他们分析了每个样本的碎片化模式,得出了DELFI评分。

 

患有病毒性肝炎或肝硬化的无癌个体得分较低,但在美国/欧盟的75例HCC患者中,平均得分高出5 - 10倍在所有癌症阶段,包括早期疾病,都观察到高分数的样本。此外,该测试还检测到了肝癌基因组内容和包装的碎片化变化,包括与肝脏特异性活性相关的基因组区域。

 

DELFI技术在肝癌的早期阶段就能检测到,其总体灵敏度(准确检测癌症的能力)为88%,特异度为98%,这意味着在处于平均风险的人群中,它几乎不会错误地提供假阳性结果。在从HCC高危人群中收集的样本中,该检测具有85%的敏感性和80%的特异性。

 

“目前,由于可及性和检测性能不佳,只有不到20%的高危人群接受了肝癌筛查。与现有的标准血液检测相比,这种新的血液检测可以使发现的肝癌病例数翻倍,并增加癌症的早期发现,”该研究的共同高级作者Kim说。研究人员表示,下一步包括在更大规模的临床研究中验证这种方法。

 

根据美国癌症协会(American cancer Society)的数据,全球每年有超过80万人被诊断出患有肝癌,这是全球癌症死亡的主要原因。

 

注:本文由院校官方新闻直译,仅供参考,不代表指南者留学态度观点。

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