航空工程是从大型而复杂的工程项目引申出来的分支，涉及各工程学科，包括机械，电机和化学工程，对从事航空工程专业人士如何提高业界的技术和高效管理是一大挑战。有见及此，香港科技大学机械及航空航天工程学系联同欧洲最大的航空学校，也是法国唯一的航空型大学Ecole Nationale de l'Aviation Civile (ENAC)合办了一个理学硕士(航空工程)课程，培训人才，以助业界面对挑战。ENAC专为航空业，特别是航空运输业，提供广泛而完整的航空专业课程。成功毕业后，学生将获得由香港科技大学和ENAC联合颁发的理学硕士 (航空工程) 学位。 香港科技大学航空工程理学硕士课程旨在装备有意透身航空工程专业的人士，或有意提升技术的业内人士。香港科技大学航空工程理学硕士课程补充了现有机械和航空航天工程本科和研究生课程的不足，可以让学生接触到航空工程的各个核心方面以及如何应用所学的专业知识在现实社会中。

1、Fluid Dynamics

2、Advanced Aerodynamics

3、Advanced Aircraft Structures

4、Advanced Aircraft Design

5、Aircraft Flight Dynamics

6、Aircraft Propulsion

7、Aeronautical Independent Project

8、Six Sigma Quality Management

9、Air Transport System Overview

10、Airplane Design Development and Operations

11、Avionics Technology

12、 Air Traffic Management Overview

13、Navigation Systems

14、Robotics: Mechanics and Control

15、Computational Aeroacoustics

1、流体动力学

2、高级空气动力学

3、高级飞机结构

4、高级飞机设计

5、飞机飞行动力学

6、飞机推进

7、航空独立研究项目

8、六西格玛质量管理

9、航空运输系统概述

10、飞机设计开发和操作

11、航空电子技术

12、 空中交通管理概论

13、导航系统

14、机器人:力学和控制

15、计算气动声学