佐治亚理工生物医学工程系是与艾茉莉大学合作开设，其研究生阶段开设有以下学位项目，分别是：

生物医学工程博士：为期4-7年（视论文完成情况），要求申请者本科毕业，拥有工程、生命科学或数学专业背景，修读过1年基于微积分的物理课程，1学期有机化学（建议2学期），4学期含微分方程的微积分课程，如申请者未满足上述前置课程要求，须在正式开学前补修上述课程，本科未设定有最低GPA要求，要求递交GRE成绩，但未设定有最低分数要求。该项目竞争非常激烈，录取率不足20%。生物医学工程项目根据合作开设的院校不同，设有以下项目，分别是：

Interdisciplinary Graduate Programs：该项目由佐治亚理工学院单独开设，该项目也同时参与到多个交叉项目中，如生物工程、生物信息学、机器人、计算科学

MD/PhD：该项目是由佐治亚理工学院生物医学工程系与艾茉莉大学医学院合作开设的双学位项目

Georgia Tech / Emory / Peking University Biomedical Engineering Ph.D. Program：由佐治亚理工学院、艾茉莉大学和北京大学合作开设的生物医学工程博士项目

Joint Georgia Tech & Emory University Biomedical Engineering Ph.D. Program：由佐治亚理工学院和艾茉莉大学合作开设的生物医学工程博士项目

生物医学创新与发展硕士：为期1年（相当于连续的3个学期），共需修读36个学分，要求申请者本科毕业，拥有工程、科学、医学或商学专业背景，本科GPA3.0以上，专业课GPA3.25以上，要求递交GRE成绩，但未设定有最低分数要求，建议拥有相关工作经验或实习经历。该项目由佐治亚理工学院单独开设，适合希望从事生物医学产品开发，比如医疗设备，生物医学早期从业者，或工程、科学、商学与医学专业本科优秀毕业生申请，无奖学金