Euglena国际网络(EIN)成立于2020年,是一个由世界各地数百名科学家组成的全球联盟,其共同目标是通过学术界和工业界之间的协作和整合组学来支持Euglena科学。曼彻斯特生物技术研究所主任Rob Field教授是EIN指导委员会的成员,他和他的实验室将成为跨学科科学家网络的一部分,致力于了解和发现800多个Euglena物种和品系的能力。
EIN今天在《生物学开放》上发表了一篇立场论文,概述了为近1000种已知的euglenoids生成高质量参考基因组的一致努力。
Euglenoids是原生生物的一部分,是不属于动物、植物或真菌类群的真核生物的家园。这些多样化的单细胞生物在世界各地异常广泛的生态系统中被发现。
多种euglenoid物种具有转化应用,生产生物燃料、营养药品、生物修复、癌症治疗,甚至作为机器人设计模拟器方面显示出巨大的前景。由于缺乏高质量的参考基因组,它们的巨大潜力在很大程度上尚未得到开发。
Euglenoid基因组呈现了一个特殊的测序挑战,因为它们是次生内共生的一个例子——包住线粒体、叶绿体和来自生物体的遗传物质的残余,它们被包住以获得这些细胞器。
因此,通过基因组学在任何水平上探索转译潜力的物种不到20个。EIN认为是时候解决这个问题了。
通过为已知的euglenoids物种生成高质量的参考基因组,EIN将致力于:
.了解euglenoids的基本生物学;
.了解优球形藻的进化;
.在生态和环境管理中最大限度地利用euglenoid;
.并探索、翻译和商业化euglenoid产品。
EIN收集的数据将通过欧洲核苷酸档案(ENA)公开提供给科学界。一旦进入ENA,注释的基因组可以导入到诸如ensemble prosts等资源中,并以统一和公平的方式呈现给研究群体。
菲尔德教授对这一领域的兴趣可以追溯到2015年,当时他和他的实验室首次描述了Euglena gracilis的意想不到的能力,包括用它来制造一系列糖和其他天然产物。从那以后,他们继续描述由Euglena产生的新型环肽抗真菌剂,这可能被证明对制药工业有用。他们希望与该网络的其他成员一起合作,更好地了解800多种Euglena,并开发它们的潜力。"在曼彻斯特生物技术研究所,我们一直在寻找具有制药潜力的新的生物活性分子,以及快速和大规模生产它们的绿色方法。虽然目前许多药物是从植物和细菌的天然产物中提取的,但藻类世界在很大程度上仍未被开发。将具有不同技能和兴趣的国际网络联合起来,为我们提供了开放藻类生物技术作为发现新药和农用化学品的一种手段的最佳机会。我们期待着2025年在曼彻斯特举办一个大型的EIN社区活动。"菲尔德教授说。
EIN的创始人总裁、英国欧洲生物信息学研究所(emble - ebi)的生物信息学家ThankGod Echezona Ebenezer博士说:“Euglena国际网络将在帮助聚集euglenoids专家方面发挥关键作用,以增加我们对euglenoids生物学及其翻译应用的理解。这可能有助于我们进一步理解寄生、社交游戏、开发喷气燃料或支持人类太空探索的进化。”
注:本文由院校官方新闻直译,仅供参考,不代表指南者留学态度观点。