曼彻斯特大学：领先的科学家使用英国基因组学数据集提出更新的全球指南，以改善罕见病诊断

这项工作由英国基因组学，曼彻斯特大学和牛津大学的科学家领导，协调来自英国，美国和澳大利亚学术和医疗机构的科学家和临床医生的专家团队。拟议的扩展指南将使临床医生和研究人员能够更好地利用全基因组序列（WGS）数据的全部变异。它们发表在一篇论文中，“对基因组非编码区域中发现的变异进行临床解释的建议”，今天出现在开放获取期刊《基因组医学》的在线版中。

这些建议解决了诊断和理解罕见疾病方面的一个重大挑战：迄今为止，大多数基因检测都集中在编码序列变异上，即那些破坏直接编码蛋白质的基因区域的变异。过去十年中为解释这些测试结果而制定的标准和指南 - 包括单基因测定和基因组合，以及包括基因组所有编码区域的全外显子组测序 - 同样关注这些类型的变异。

然而，尽管这些标准为使用此类测试提供一致和可靠的诊断提供了坚实的证据驱动框架，但编码区域最多占基因组的2%。随着负担得起的WGS的出现及其在临床实践中的日益普及，正在检测到越来越多的许多不同类型的潜在致病变异，但没有类似的系统标准供社区评估其对疾病的影响。结果是“重要性不确定的变异”（VUS）的扩散，其中一些具有与致病编码变异相同的下游临床影响，但通过不同的机制起作用，因此更难评估。

我们很高兴能够向全球临床和科学界提出这些建议。

——杰米·埃林福德博士

在为WGS时代提出对这些指南的更新时，作者明确地侧重于建议与现有指南一起进行的改编和扩展，并使用与创建它们相同的协商和共识建立策略。利用英国基因组学在临床WGS方面的领先专业知识以及来自100，000名基因组计划参与者的数据，这些建议是由来自英国主要基因组学实验室的九名临床和研究科学家组成的小组起草的。其中包括四个NHS基因组实验室中心，为基因组医学服务（GMS）和牛津大学惠康人类遗传学中心提供服务。建议草案由另外一组临床科学家使用30个测试变体进行测试;由来自英国的一组变体解释专家，马萨诸塞州剑桥的布罗德研究所以及澳大利亚的Garvan研究所和默多克儿童研究所等机构改进。

英国基因组学罕见病首席基因组数据科学家，曼彻斯特大学研究员，该研究的联合负责人Jamie Ellingford博士说：“我们很高兴能够向全球临床和科学界提出这些建议。我们希望它们的采用将成为标准化和完善更多VUS特征的有用起点。通过这样做，我们相信我们将能够靶向VUS的一个子集，并为如何创建适当的功能证据来询问这些变异的致病性并为英国和世界各地的患者提供更多诊断提供指导。

小组负责人Nicky Whiffin博士和牛津大学研究员，该研究的联合负责人Henry Dale爵士说：“我们的目标是促进患者获得更有价值的遗传诊断。随着我们获得越来越多的全基因组测序数据，越来越清楚的是，基因组中不直接编码蛋白质的区域的变异在罕见疾病中起着重要作用。这些建议使我们能够充分解释这些变异并在临床上利用它们，从而改善诊断和个性化治疗。

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