大学公园，宾夕法尼亚州-宾夕法尼亚州立大学微生物组中心与计算机科学、工程和生物学副教授、宾夕法尼亚州立大学哈克生命科学研究所联合雇佣的David Koslicki的实验室合作，向宾夕法尼亚州立大学所有教职员工和学生免费提供基因和基因组京都百科全书(KEGG)。 该数据库可以通过在宾夕法尼亚州立大学微生物组中心KEGG镜像站点上使用宾夕法尼亚州立大学的证书登录访问。

KEGG是一个人类策划的数据库，用于生命科学的所有主要领域，以预测和了解植物、动物和微生物的代谢途径，这些代谢途径驱动研究人员在生物体、种群或社区水平上看到的特征和生物影响。 它是一个综合性的资源，旨在提供细胞中基因、蛋白质和小分子之间分子相互作用的全局视图。 它包含了无数的生物信息，包括基因组、生物途径、疾病、药物和化学物质，并用于大规模的大数据分析，从宏基因组学到代谢组学、基因组学和转录组学，Koslicki说。

Koslicki说:“我对开发一种进行宏基因组功能分析的工具很感兴趣，我们从微生物群落中提取DNA，然后确定样品中存在哪些基因，以了解该群落能够做什么。” “为了做到这一点，我需要一个参考数据库，其中包含我们所知道的所有基因的信息，它们之间的关系，以及它们的功能。 KEGG是最自然的选择，因为它是最古老、最坚固的生物信息学存储库之一，可以追溯到1995年，它已经被用于许多发现。 ”

Kosllicki说，该数据库还包括基因表达、蛋白质-蛋白质相互作用和小分子-蛋白质相互作用的信息。 这对于了解毒素和抗菌化合物的生物合成、营养循环等都很重要。

Koslicki说:“然而，KEGG是一种基于订阅的服务，很难获得资金来支持访问这些类型的存储库。” “事实证明，机构订阅的费用并不比个人订阅高得多，所以我联系了微生物组中心主任Seth Bordenstein和Dorothy Foehr Huck和J. Lloyd Huck在微生物组科学中担任捐赠主席，他非常支持不仅向微生物组中心的其他成员提供这种资源，而且还向更广泛的宾夕法尼亚州立大学社区提供这种资源。 塞斯马上就投入了这个项目，他看到了它可能带来的价值，让宾夕法尼亚州立大学的这么多研究人员可以用相对较小的投资获得它，这真是太棒了。 ”

除了数据库资源外，KEGG还提供了许多用于分析和解释生物数据的计算工具。 这些工具包括KEGG Mapper，它允许用户可视化和分析路径和网络; KEGG Orthology (KO)数据库，提供蛋白质之间进化关系的信息; 以及KEGG自动注释服务器(KAAS)，它可以注释新测序的基因组。

“微生物组中心是一个社区，作为我们微生物世界的研究、教育和合作的标准承载者，进入了下一个层次，”Bordenstein说，他也是生物学和昆虫学教授。 “凭借大卫在计算微生物组科学方面的远见卓见，以及该中心对资源创新的优先考虑，我们现在可以免费访问一个卓越的数字数据库，用于集成基因组学、化学和生命生物系统的功能信息。 我们期待着KEGG的大规模内容对宾夕法尼亚州立大学的发现、论文和资助的影响。 ”

注：本文由院校官方新闻直译，仅供参考，不代表指南者留学态度观点。