全球生物数据联盟(GBC)是一个国际资助者联盟,今天宣布了第一份全球核心生物数据资源(GCBRs)名单,其中包括37种资源,这些资源的长期资助和可持续性对全球生命科学和生物医学研究至关重要。其中两个,WormBase和基因组资源联盟是由加州理工学院领导的。
布伦大学生物学教授保罗·斯特恩伯格说:“这是向国际社会努力开发这些全球使用但只在当地资助的项目迈出的巨大第一步。”“这也很好地证明了我们一直在为研究人员提供信息。”
WormBase是加州理工学院领导的多机构合作项目,旨在向全世界免费提供线虫或蛔虫的遗传信息。据认为,地球上生活着多达100万种线虫,其中许多是破坏作物和传播疾病的害虫或寄生虫。它们还碰巧分享了许多人类的基因。因此,世界各地的实验室都在对这种蠕动的生物进行深入研究。
WormBase项目始于2000年,最初的目标是创建一个与研究最广泛的线虫——模式生物秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)相关的在线知识库。该项目的网站(www.wormbase.org)现在拥有50多种线虫物种的基因组数据以及大量的其他实验数据。每年大约有1200篇科学论文被添加到这个可搜索的数据库中。目前已有1000多个实验室注册为用户,WormBase是生物医学和农业研究界的宝贵工具。
基因组资源联盟开发和维护可持续的基因组信息资源,促进利用不同的模式生物来了解人类生物学、健康和疾病的遗传和基因组基础。这种理解对于推进基因组生物学研究和将人类基因组数据转化为临床应用是至关重要的。通过实施共享的模块化信息系统架构,该联盟寻求为不同的用户群体提供服务,包括希望获得同源人类基因的所有模型生物数据的人类遗传学家;基础科学研究人员,他们使用特定的模式生物来了解基础生物学;以及计算生物学家和数据科学家,他们需要获得标准化的、结构良好的数据。
该联盟包括多个数据库,包括FlyBase、小鼠基因组数据库、大鼠基因组数据库、酵母基因组数据库、WormBase、Xenbase、斑马鱼信息网络和基因本体联盟。
加州理工学院参与这两个项目的研究人员包括Valerio Arnaboldi、Juancarlos Chan (BS '00)、Wen Chen (PhD '00)、Jae Hyoung Cho、Christian Grove、Ranjana Kishore、Raymond Lee、Nicholas Markarian、Jane Mendel、Hans-Michael Muller (PhD '99)、Cecilia Nakamura、Daniela Raciti、Gary Schindelman、Kimberly Van Auken、Qinghua Wang和Karen Yook。
“就像生态系统中的关键物种一样,gcbr代表着全球生命科学数据基础设施中最关键的组成部分或节点,它们的失败将对全球研究工作产生关键影响。”GBC的新闻稿说。“gcbr的一个关键特性是,它们所持有的数据是公开的,全世界的研究人员都可以不受限制地访问和使用。”
注:本文由院校官方新闻直译,仅供参考,不代表指南者留学态度观点。