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伦敦大学学院 | 伦敦大学学院领导的团队在世界上最强大的计算机上赢得了时间
指南者留学 2023-01-14 19:39:27
阅读量:1279

位于美国田纳西州橡树岭领导计算中心的超级计算机“前沿”是世界上第一台能够每秒运算十亿次的超级计算机。Peter Coveney教授(就职于伦敦大学学院化学系和伦敦大学学院高级研究计算中心)领导的研究小组是获得新计算机使用权的研究小组之一,从1月1日它投入生产的那一刻开始。

 

该团队将在两个项目中使用Frontier。其中一个目标是通过使用人工智能(AI)算法来筛选数百万种化合物,并确定最有前途的候选药物,然后在实验室进行测试,并有可能快速进入临床试验,从而加快药物发现速度。

 

在第二个项目中,这台超级计算机将被用于模拟中风后几秒钟内大脑中的血液流动。该团队将利用高分辨率成像数据,构建大脑的一部分,即威利斯环的数字副本。他们将模拟不同情况下动脉堵塞后的血液流动,观察这如何改变动脉壁的压力,并推断大脑的哪些区域可能最容易受到中风的影响。

 

柯文尼教授说:“‘前沿’比世界上任何其他超级计算机都领先了一大步。这是绝对可能的巅峰,开辟了以前无法进入的科学新领域。通过快速确定潜在药物的候选名单,我们希望加快缓慢而昂贵的药物发现过程,在早期阶段进行计算,而不是在实验室中进行。这将使制药公司能够迅速转向有可能成功的化合物,从而改进通常需要10年时间、耗资数十亿美元且往往以失败告终的过程。

 

“与此同时,了解中风如何破坏大脑中的血液流动,应该可以更好地预测一个人的中风风险。这是因为每个人的血管结构都有很大的不同,所以在动脉的同一位置中风对不同的人会有不同的后果。因此,一些人中风的风险会高得多。”

 

“了解中风的可能影响也可以为最佳治疗方案的决策提供信息。”

 

考文尼教授的团队包括来自牛津大学和芝加哥大学、罗格斯大学和美国阿贡国家实验室的研究人员,他们通过美国能源部科学办公室举办的一个名为INCITE(对理论和实验的创新和新颖计算影响)的奖励计划获得了进入Frontier的机会。

 

digital replica of blood vessels in the brain 

INCITE项目由阿贡领导计算设施(ALCF)和橡树岭领导计算设施(OLCF)联合管理。

 

OLCF所在的国家计算科学中心主任吉娜·图拉西教授说:“今年对我们来说是非常重要的一年。用户现在可以使用的机器功能几乎是我们之前旗舰系统的十倍。”

 

ALCF主任Michael E. Papka教授说:“这些项目有望代表科学界的最佳状态。今年分配的科学学科的广度和方法的多样性——更不用说致力于推动这项工作的研究人员——展示了领导计算系统的力量和潜力,随着我们过渡到百亿亿次时代,不断发展的数据科学、人工智能、模拟及其交叉点的更大能力和影响,加速发现。”

 

INCITE提案由国际专家组成的同行评审小组进行评估,每个小组代表不同的科学学科。每个计算设施还会在技术层面上评估这些建议的计算就绪性和项目代码及其算法的可伸缩性。INCITE奖项委员会根据这些建议做出最终选择。

 

柯文尼教授的团队在Frontier上获得了52万节点小时的计算能力,比英国最强大的计算机快50倍,在另一台超级计算机北极星上获得了7.5万节点小时的计算能力。

 

注:本文由院校官方新闻直译,仅供参考,不代表指南者留学态度观点。

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